蚯蚓有機肥質輕、粒細均勻，無異味，干凈衛生，保水保肥，養分全面，結構及功用特別，可全面應用于各培養物，基至可應用于貴重魚蝦的飼養。因為蚯蚓有機肥價格相對較高，而且數量有限，現在的首要應用規模有：

①蝦塘、跳魚塘育肥

②有機茶培養、有機生果、蔬菜培養

③花圃、花卉養分土、草坪卷養分土或追肥

④土壤改良介質

⑤高爾夫球場、足球場養分土或追肥

⑥家庭盆花、溫室花卉、高級花卉培養基質

⑦貴重細微種子培養基

⑧新培養或新移植的樹木、灌木促生養分土

⑨無土培養基質、輕型屋頂花園

⑩魚、蝦飼料

      別的，據《本草綱目》記載：“蚯蚓有機肥又稱蚯蚓泥，六一泥，性味破舊無毒、有泄熱、利小便之奇效”?，F行的中醫丹方大全中有多個處方把蚯蚓有機肥作為中藥使用。