蚯蚓糞有機肥與普通有機肥的根本區別：

1、普通有機肥因未完全發酵，存在施用后二次發酵而導致燒苗的問題，而且有異味，甚至異臭，而蚯蚓糞不存在這些問題。

2、普通有機肥未把各種養分全部轉化成簡單、易溶于水的簡單物質，不易被植物攝取，而蚯蚓糞極易被植物吸收。

3、蚯蚓糞是堅固的團粒結物。保水性、排水性強，長期使用不會分散壓密，這是普通有機肥無法辦到的。

4、蚯蚓糞富合腐植酸和大量的有益微生物菌、18種氨基酸和多種微量元素，而這些在普通有機肥中含量都很少。

5、蚯蚓糞中含拮抗微生物，可抑制土傳病害，而有普通存機不存在有這種微生物。